一、職能調整
　　（一）劃出的職能。
　　１．將律師資格考試的具體工作和律師的專業培訓、獎懲及對外宣傳等職能，交給中華全國律師協會。
　　２．將公證員資格考試的具體工作和公證員專業培訓、獎懲及公證宣傳等職能，交給中國公證員協會。
　　（二）劃入的職能。
　　指導和管理企業法律顧問工作。
　　（三）下放的職能。
　　１．將地方政法院校的教學評估、專業設置、中專統考等職能，交給地方人民政府。
　　２．將直屬單位非公務出國人員護照的審批、申領、日常管理等職能，交給各直屬單位。

　二、主要職責
　　根據以上職能調整，司法部的主要職責是：
　　（一）研究擬定司法行政工作的方針、政策和法律、法規，編制司法行政工作的中長期規劃、年度工作要點并監督實施。
　　（二）指導監督執行刑罰、改造罪犯的工作，指導管理監獄工作。
　　（三）指導監督勞動教養工作。
　　（四）制訂法制宣傳和普及法律常識規劃并組織實施，指導各地方、各行業依法治理工作和對外法制宣傳。
　　（五）指導監督律師、法律顧問、法律援助工作和公證機構及公證業務活動。負責委托香港特別行政區和澳門地區公證律師辦理公證事務。
　　（六）指導地方司法行政機關管理人員調解工作及司法助理員、基層司法所和基層法律服務工作。
　　（七）受全國人大和國務院委托，參與國家有關法律的草擬工作。參與制訂有關香港特別行政區及澳門、臺灣地區的法規，承辦涉香港特別行政區及澳門、臺灣法律事務。組織司法領域人權問題研究。管理直屬高等政法院校，指導法學教育和法學理論研究。
　　（八）組織參加聯合國有關國際司法協助條約的草擬、談判，負責國際司法協助協定執行的有關事宜。指導司法行政系統的外事工作，承辦聯合國有關對口部門的往來業務，組織參加國際有關人權問題的法律研討和交流活動，開展政府間的法律交流與合作。
　　（九）指導管理司法行政系統的計劃財務及槍支、彈藥、服裝、車輛等物資裝備。
　　（十）指導司法行政系統的隊伍建設和思想政治工作，管理機關和直屬單位的人事工作，指導管理司法行政系統的警務和警銜評授工作，協助省、自治區、直轄市管理司法廳（局）領導干部。
　　（十一）承辦國務院交辦的其他事項。

　三、內設機構
　　根據上述職責，司法部設９個職能司（局、廳）和政治部：
　　（一）辦公廳
　　研究擬定司法行政工作發展戰略和中長期規劃、年度工作要點并監督實施。收集、分析、反饋各類司法行政信息。負責機關重大政務活動的協調安排和督查督辦。負責綜合性文件和報告的起草、審核，組織新聞發布工作。指導全國司法行政通信信息技術網絡建設。負責機關接待、保密保衛工作，承擔文電審核和收發運轉工作，受理群眾來訪和控告申訴。管理機關檔案庫。
　　（二）監獄管理局
　　監督檢查有關罪犯改造工作的法律、法規和政策的執行情況。規劃全國監獄的設置和布局，指導監獄刑罰執行、獄政管理和教育改造，掌握重要犯罪的有關押改造情況，組織協調省際之間的調犯工作。指導全國監獄的生產、基建、裝備、財務和國有資產的保值增值。管理直屬監獄。組織司法領域人權問題的研究。
　　（三）勞動教養管理局
　　監督檢查勞動教養法律、法規和政策的執行情況，指導對勞動教養人員的管理、教育、警戒和強制治療等工作，規劃勞教場所的設置和布局，指導勞教場所的生產、基建、財務、裝備等工作。
　　（四）法制宣傳司
　　擬定全民普法教育規劃并組織實施，指導檢查依法治理工作，指導法制宣傳報道和對國（境）的法制宣傳工作。
　　（五）律師公證工作指導司
　　組織指導律師資格統一考試，授予律師資格。指導監督政府、企事業單位的法律顧問工作和社會法律服務機構的工作。審批和管理外國及香港特別行政區及澳門地區律師事務所駐華（內地）辦事機構，指導監督律師事務所在國（境）外設立分支機構。組織指導公證員的考試（考核）、任命及注冊，指導管理公證機構的設置，監督公證業務活動。負責委托香港特別行政區及澳門地區的建設擔任委托公證人工作。
　　（六）基層工作指導司
　　指導地方司法行政機關管理基層司法所、司法助理員、法律服務和人員調解工作。組織指導對刑滿釋放人員和解除勞動教養人員的安置幫教工作。
　　（七）法規教育司
　　受全國人大和國務院的委托，參與國家有關法律的草擬工作。組織擬定司法行政法律、法規和規章，制定在職政法干部、企業法律顧問培訓規劃并組織實施，指導仲裁登記。負責司法行政涉香港特別行政區及澳門、臺灣事務。指導法學專業社團和面向社會服務的司法鑒定工作。指導法學教育、科研和理論研究工作，指導直屬高等政法院校、培訓中心的教學科研。
　　（八）司法協助外事司
　　參加與外國簽訂各種有關司法協助條約的談判，管理司法協助協定的執行事宜。組織參加聯合國預防犯罪和刑事司法領域的活動，承辦聯合國有關對口部門的往來業務，組織參加有關司法、法學領域的多邊或雙邊交流、技術合作和技術援助，研究各國的司法制度和司法實踐。管理機關、直屬單位的外事工作。
　　（九）計財裝備司
　　研究制定司法行政系統的財務、物資裝備、基本建設的規劃制度，監督司法行政系統業務經費使用情況，負責機關、直屬單位的國有資產和財務管理。管理司法行政系統的槍支、彈藥、服裝、車輛等物資裝備。
　　政治部（含人事警務局、組織宣傳局）。指導司法行政系統隊伍建設、干部教育、宣傳和思想政治工作。研究制定司法行政系統人事管理辦法。指導地方司法行政機關的人事管理工作，對協管干部進行考核并提出任免、交流意見。負責警務、警銜評授等工作。負責機關機構編制、國家公務員管理和直屬單位的人事工作。
　　機關黨委。負責部機關和在京直屬單位的黨群工作。

　四、人員編制
　　司法部機關行政編制為２２０名。其中：部長１名，副部長４名，司局級領導職數３４名（含政治部司局級領導職數和機關黨委專職副書記）。
　　離退休干部工作機構、后勤服務機構及編制，按有關規定另行核定。